井下架线式电机车使用电气制动具有以下缺点：

首先，井下架线式电机车的电气制动系统受到电机的特性和性能限制。由于电机的机械结构和电磁特性，电气制动的效果在低速运行时较为有限。当列车速度降低到一定程度以下时，电机无法产生足够的电气制动力，制动距离相对较长。

其次，电气制动所依赖的是牵引电动机的反电动势，需要通过牵引电动机的励磁电流来产生制动力。因此，如果电动机的励磁系统出现故障或者励磁电流不稳定，将影响电气制动的可靠性和稳定性。

此外，井下架线式电机车使用电气制动还需要考虑电源供应和电能回馈的问题。电气制动时会产生大量的回馈电能，如果没有适当的回馈电能吸收和利用装置，会对电网产生冲击和负荷变化，可能导致电网不稳定或过载。

综上所述，井下架线式电机车使用电气制动虽然存在一些限制性因素，但在适当的条件下仍具备一定的应用价值。对于井下工矿环境，除了电气制动，还需要综合考虑其他制动方式的配备，以确保列车的安全运行。